Ensembl tips 〜DBCLSで提供しているゲノムアノテーションを表示する〜
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Tags: bodymap DAS dbcls ensembl togotv 使い方 生命科学 統合TV
高画質はこちら http://togotv.dbcls.jp/movie/080418ensembltips4_f.html Ensembl は、 The Wellcome Trust Sanger InstituteとEBI(European Bioinformatics Institute) の共同で開発、維持されているゲノムブラウザ、ゲノムアノテーション閲覧システムのことです。 第四弾の今回は、DBCLS で提供しているゲノムアノテーションをDAS(Distributed Annotation System)を用いてEnsemblに追加して表示する方法について紹介しています。今回は、ヒト、マウスの遺伝子発現を組織細胞の種類ごとに解析したデータベースであるBodyMapのESTデータをEnsembl上で表示させています。
新聞検索を使い倒す
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Tags: dbcls togotv 使い方 新聞 生命科学 統合TV
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/movie/080718newspaper_f.html DBCLSが統合ホームページで提供するサービスの一つとして新聞記事検索があります。ここでは、生命科学の分野に関連した毎日新聞の記事を簡単に検索することができます。
生命科学系データベースカタログを使い倒す
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Tags: dbcls togotv データベースカタログ 使い方 生命科学 統合TV
高画質はこちら http://togotv.dbcls.jp/20080508.html 生命科学系データベースカタログは、 ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)が提供する「データベースのデータベース」です。データベースが数多く存在する昨今、データベースをうまく使いこなすことが研究の進展を左右するといっても過言ではありません。しかし実際の利用者からは「必要なデータベースが見つからない」「何のデータベースがあるのか分からない」という声をよく聞きます。 生命科学系データベースカタログでは、国内外のデータベースを目的や対象、生物種、提供機関別に分類し、それらの説明が日本語で書かれているのが特徴です。また個々のデータベースについて利用者がコメントをつけることもできます。
学会要旨統合検索を使い倒す
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Tags: dbcls togotv 使い方 学会 生命科学 統合TV 要旨
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20080801.html DBCLSが統合ホームページで提供するサービスの一つとして学会要旨統合検索があります。ここでは、生命科学の分野に関連した学会の講演要旨を簡単に検索することができます。
生命科学 学協会 カタログを使い倒す
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Tags: dbcls togotv カタログ 使い方 協会 学会 生命科学 統合TV
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20080826.html DBCLSが統合ホームページで提供するサービスの一つとして生命科学 学協会 カタログがあります。 ここでは、生命科学に関連した様々な学協会を検索し、簡単にそのカタログやホームページを閲覧することが出来ます。
「統合ホームページ」でデータベース横断検索を使いこなす
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Tags: dbcls togotv 使い方 横断検索 生命科学 統合TV
高画質版はコチラ http://togotv.dbcls.jp/20071005.html 2007年10月5日にDBCLSが提供するライフサイエンスデータベースのポータルサイト「統合ホームページ」が公開されました。 今回はその公開を記念して数あるコンテンツのうちからライフサイエンスデータベース横断検索を取り上げ、その使い方および注意点について簡単に説明します。
Ensemblゲノムブラウザを使って遺伝子を眺める
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Tags: dbcls ensembl togotv 使い方 生命科学 統合TV
高画質版はコチラ http://togotv.dbcls.jp/20070912.html Ensembl では、ゲノム配列上の遺伝子や各種マーカー、SNPなどを眺めることができます。 ある遺伝子がゲノム配列上の「どこ」にあって、その周辺に「何」があるのか調べることは、地図から目的の場所を調べるのと似ています。 ここでは、ゲノムブラウザの使い方の一つ（ゲノムブラウザは色々な使い方ができます！）を、Googleマップと対比させて説明しています。
生物アイコンを使い倒す
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Tags: dbcls togotv アイコン 使い方 学名 生命科学 生物 画像 統合TV
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20080704.html DBCLSが統合ホームページで提供するサービスの一つとして生物アイコンがあります。ここでは、生命科学の分野でしばしば登場する生物の学名に対応した和名と画像が分類ごとに整理されています。ここに載っている生物の画像はクリエイティブ・コモンズ・ライセンスのもとで自由に使用することが可能です。
蛋白質核酸酵素全文検索を使い倒す
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Tags: dbcls togotv タンパク質 使い方 核酸 生命科学 統合TV 酵素
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/movie/080912TKsearch_f.html DBCLSが統合ホームページで提供するサービスの一つとして蛋白質核酸酵素全文検索があります。 ここでは、生命科学分野の総合レビュー誌で、和文総説誌として唯一PubMedにも掲載されている蛋白質核酸酵素（共立出版）のバックナンバーを全文検索することができます。自分の専門外の分野について概要を知りたいときなどに役立ちます。
PCRプライマー設計ツール Primer3の使い方
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Tags: dbcls DNA PCR primer primer3 togotv 使い方 生命 科学 統合TV 設計
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20080808.html Primer3はPCR用のプライマーを設計するためのツールです。PCR実験成功の可否は、プライマー設計によるところが大きいですが、本ツールはWebブラウザ上で、実験条件に合った様々なパラメータを考慮しながらプライマー設計を行うことが可能です。 ここでは例としてヒトの脂肪代謝遺伝子peroxisome proliferator-activated receptor(PPAR) gammaの塩基配列をサンプル配列として、設定可能なパラメータ項目の説明を交えながらPrimer3の使い方を説明します。
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